W Kujawsko-Pomorskim Centrum Pulmonologii w Bydgoszczy prowadzone są centralne rejestry i ewidencje:
- Rejestr skarg i wniosków,
- Rejestr zarządzeń wewnętrznych,
- Rejestry umów,
- Rejestr kontroli,
- Rejestr korespondencji wpływającej,
- Ewidencja pracowników,
- Ewidencja środków trwałych,
- Rejestr chorób zawodowych,
- Rejestr wypadków przy pracy,
- Rejestr szkodliwych czynników dla zdrowia,
- Rejestr zamówień publicznych,
- Księga główna przyjęć i wypisów.